Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trappc13Q3TIR1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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