Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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