Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Perm1Q149B8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms