Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms