Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms