Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms