Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ufm1P61961 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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