Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms