Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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GdnfP48540 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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GdnfP48540 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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