Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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VhlP40338 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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VhlP40338 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
VhlP40338 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms