Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms