Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Hoxc11P31313 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Hoxc11P31313 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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