Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd28P31041 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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