Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms