Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Hoxd12P23812 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Hoxd12P23812 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Hoxd12P23812 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hoxd12P23812 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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