Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PparaP23204 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PparaP23204 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms