Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
P20040 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P20040 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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