Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms