Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms