Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cops6O88545 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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