Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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