Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms