Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm2035J3QP87 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm2035J3QP87 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm2035J3QP87 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm2035J3QP87 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm2035J3QP87 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm2035J3QP87 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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