Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm13999-201ENSMUST00000141511 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nkx1-1G3UXB3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx1-1G3UXB3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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