Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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