Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms