Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Prr29B1ARI9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Prr29B1ARI9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Prr29B1ARI9 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Prr29B1ARI9 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Prr29B1ARI9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr29B1ARI9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prr29B1ARI9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prr29B1ARI9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prr29B1ARI9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prr29B1ARI9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prr29B1ARI9 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prr29B1ARI9 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr29B1ARI9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms