Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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