Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PapolbQ9WVP6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PapolbQ9WVP6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms