Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms