Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms