Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DysfQ9ESD7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms