Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Hmg20aQ9DC33 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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