Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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