Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms