Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nop56Q9D6Z1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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