Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms