Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hdhd3Q9CYW4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms