Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Sgo1Q9CXH7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Sgo1Q9CXH7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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