Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Xrcc3Q9CXE6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms