Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms