Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krt88Q9CPR6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms