Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms