Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms