Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms