Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms