Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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