Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ssh3Q8K330 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms