Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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