Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms